Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAPBO95292 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAPBO95292 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAPBO95292 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPBO95292 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPBO95292 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPBO95292 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPBO95292 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPBO95292 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPBO95292 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPBO95292 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPBO95292 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPBO95292 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAPBO95292 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms