Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEBLO76041 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEBLO76041 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEBLO76041 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEBLO76041 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
NEBLO76041 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEBLO76041 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEBLO76041 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEBLO76041 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEBLO76041 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEBLO76041 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEBLO76041 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEBLO76041 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEBLO76041 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEBLO76041 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEBLO76041 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEBLO76041 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEBLO76041 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEBLO76041 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEBLO76041 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms