Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F6O75461 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F6O75461 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms