Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STX6O43752 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STX6O43752 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STX6O43752 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX6O43752 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX6O43752 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX6O43752 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STX6O43752 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STX6O43752 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms