Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBDO15205 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBDO15205 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBDO15205 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBDO15205 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBDO15205 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBDO15205 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBDO15205 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBDO15205 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBDO15205 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBDO15205 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBDO15205 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBDO15205 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBDO15205 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBDO15205 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBDO15205 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBDO15205 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBDO15205 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms