Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A2O14975 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms