Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F3O00716 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F3O00716 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F3O00716 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F3O00716 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F3O00716 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F3O00716 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F3O00716 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F3O00716 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F3O00716 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F3O00716 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F3O00716 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F3O00716 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F3O00716 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F3O00716 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F3O00716 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F3O00716 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F3O00716 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F3O00716 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F3O00716 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms