Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EBAG9O00559 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms