Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9PMD0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9PMD0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
E9PMD0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PMD0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PMD0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PMD0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PMD0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms