Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGB1P1B2RPK0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms