Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SDR42E2A6NKP2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SDR42E2A6NKP2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms