Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RNF222A6NCQ9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms