Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB4A4D0S4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMB4A4D0S4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms