Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMX2A2RU54 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMX2A2RU54 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms