Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRGMA1A4Y4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRGMA1A4Y4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms