Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF3-202ENST00000338458 3639 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LOX-201ENST00000231004 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TIAM1-207ENST00000636887 4160 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM239-201ENST00000361033 3892 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 EHD2-201ENST00000263277 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 EXD2-203ENST00000409018 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CTPS2-202ENST00000380241 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PRDM10-201ENST00000304538 5817 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF597-201ENST00000301744 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF526-201ENST00000301215 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZKSCAN5-203ENST00000451158 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDH9-204ENST00000544246 6234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TTLL3-221ENST00000455274 2848 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CHD3-201ENST00000330494 7328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 UST-201ENST00000367463 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDH11Y-202ENST00000333703 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TFIP11-202ENST00000407148 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CANT1-216ENST00000620915 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0319-202ENST00000430948 6620 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 C4orf50-201ENST00000324058 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MFAP3L-201ENST00000361618 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PLA2G4C-219ENST00000599111 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GALNT17-205ENST00000618959 3012 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MTR-205ENST00000535889 10405 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MCM5-202ENST00000382011 2402 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 USP4-202ENST00000351842 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF4BP3-201ENST00000432132 1850 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RASGRP4-220ENST00000622174 2651 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGA8N-201ENST00000448387 5329 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GEMIN4-201ENST00000319004 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM47B-201ENST00000329357 2120 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CUL9-202ENST00000372647 7684 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NAGA-201ENST00000396398 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PAMR1-205ENST00000611014 2613 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF548-202ENST00000366197 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF623-202ENST00000501748 6759 ntAPPRIS P3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 IFT172-201ENST00000260570 5415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.2 ms