Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ARNT2-207ENST00000533983 6690 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SYT2-202ENST00000367268 7598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KRTAP21-2Q3LI59 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms