Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 GRK1-201ENST00000335678 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMA4-219ENST00000522006 6438 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AMPD2-202ENST00000342115 3728 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN4A-201ENST00000435607 7805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IL17RD-202ENST00000320057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A9-201ENST00000031146 5192 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100868.1-201ENST00000262283 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162274.3-201ENST00000623138 3109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MATN1-201ENST00000373765 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGA7-213ENST00000555728 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NCMAP-201ENST00000374392 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FNIP2-201ENST00000264433 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PNMA6F-201ENST00000436629 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CECR2-204ENST00000400585 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR3H-203ENST00000396504 4176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092447.8-201ENST00000566570 4162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2D-201ENST00000272645 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NOP2-203ENST00000399466 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 EXD2-201ENST00000312994 5107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ITIH5-202ENST00000397146 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PFKM-210ENST00000547587 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZDHHC9-201ENST00000357166 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LYPLA2P3-201ENST00000417429 576 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A13-204ENST00000440685 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL623P-201ENST00000494330 310 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CR545473.1-201ENST00000511554 277 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC134698.2-201ENST00000519172 311 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008438.2-201ENST00000520443 570 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS28-204ENST00000526054 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNJL-208ENST00000541762 2965 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC131157.1-201ENST00000547902 722 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099668.1-201ENST00000563780 423 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091062.1-201ENST00000572491 457 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3190-201ENST00000577414 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005324.1-203ENST00000580194 541 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024619.3-201ENST00000582196 323 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL200P-201ENST00000585129 288 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008753.3-201ENST00000595160 446 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.25-201ENST00000600454 283 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.6 ms