Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 MTMR3-203ENST00000351488 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 E2F8-205ENST00000620009 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 NFRKB-201ENST00000446488 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 EPX-201ENST00000225371 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 GOLGA2-201ENST00000421699 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 C19orf44-201ENST00000221671 3427 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 DAPK2-201ENST00000261891 2603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 KIR3DX1-205ENST00000610811 3325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 SEC24D-201ENST00000280551 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 LHX6-202ENST00000373754 3278 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 TACC2-206ENST00000368999 3879 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 C1RL-AS1-205ENST00000541775 5272 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP2A1-203ENST00000536376 3130 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 MARF1-205ENST00000548025 5891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF436-202ENST00000374608 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SEMA4D-208ENST00000422704 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ANPEP-201ENST00000300060 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ORC2-201ENST00000234296 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 C1S-201ENST00000328916 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PRKG1-203ENST00000373980 6928 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM231-201ENST00000258173 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM246-201ENST00000374847 4223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 LRRC37A11P-201ENST00000425901 3580 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RABGEF1-208ENST00000510829 3553 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 HADHAP2-201ENST00000540341 2285 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 THSD7A-202ENST00000423059 10663 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPS1-201ENST00000220888 5480 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MYO10-212ENST00000515803 4839 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SCN1B-208ENST00000640135 4846 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC7A6OS-201ENST00000263997 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 DMBX1-202ENST00000371956 2882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 CHD3-201ENST00000330494 7328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PAK5-203ENST00000378429 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MTMR11-202ENST00000439741 2827 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AP000892.3-201ENST00000624094 5326 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 C4orf50-201ENST00000324058 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TLR5-201ENST00000366881 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 NR2F1-AS1-213ENST00000607797 3380 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SPIN3-223ENST00000639525 3958 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ANGEL1-201ENST00000251089 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PAN2-201ENST00000257931 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 BEND3-202ENST00000429433 6654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 CCR9-202ENST00000357632 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEKHM3-204ENST00000457206 3689 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 CXCR1-201ENST00000295683 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PAFAH2-201ENST00000374282 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM19A2-201ENST00000416284 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 BTBD18-201ENST00000422652 3044 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00494-201ENST00000416742 3544 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms