Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 COA7-201ENST00000371538 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 BRD7-201ENST00000394688 5370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPN3-206ENST00000397163 3228 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM78A-202ENST00000372269 3659 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007938.4-201ENST00000610046 4118 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CSF3R-202ENST00000361632 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF169-202ENST00000395395 1986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN22-201ENST00000329665 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT17-202ENST00000562034 5092 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNJ1-202ENST00000382491 6958 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MRVI1-215ENST00000541483 2468 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN5-203ENST00000376091 3046 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CD22-204ENST00000536635 3004 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DCBLD2-202ENST00000326857 3959 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF3C2-202ENST00000359541 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL021877.1-201ENST00000457251 2194 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX8-201ENST00000262415 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SFXN5-201ENST00000272433 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPAN2-202ENST00000369516 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM16-202ENST00000416464 3184 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ARSJ-201ENST00000315366 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 HPSE-202ENST00000405413 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37A2-203ENST00000576629 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRB5-201ENST00000316219 3236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 PREX2-201ENST00000288368 10750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 NMNAT1-201ENST00000377205 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CSPG4P10-201ENST00000456932 4817 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TGFA-201ENST00000295400 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MT2P1-201ENST00000262499 183 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 OBP2A-201ENST00000340780 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 SAA1-201ENST00000356524 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR210-201ENST00000362168 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP154-201ENST00000410136 290 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092580.2-201ENST00000414654 469 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOBP3-201ENST00000416023 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTP1-201ENST00000440793 383 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL13P5-204ENST00000441655 618 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP21-4P-201ENST00000454921 816 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL851P-201ENST00000480512 303 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 OR6W1P-201ENST00000490285 1098 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136604.3-202ENST00000514793 485 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP4-12Q9BQ66 CCAR2-208ENST00000521301 337 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms