Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012508.1-201ENST00000564121 4476 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00930-202ENST00000557075 1541 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHRNB1-208ENST00000576360 1837 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AMPD3-208ENST00000528723 2753 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTRR-201ENST00000264668 3274 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBBP8-205ENST00000399725 3260 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNX20-201ENST00000300590 3304 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCAF4L2-201ENST00000319675 3326 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC183088.1-201ENST00000626622 3398 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIK1-205ENST00000399909 3427 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF417-201ENST00000312026 3597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXO18-202ENST00000379999 3702 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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KRTAP9-4Q9BYQ2 COL6A3-205ENST00000392004 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004877.1-201ENST00000608963 4093 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKAP13-221ENST00000560579 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC5-201ENST00000258821 4779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC26A9-203ENST00000367135 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCC11-203ENST00000394747 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 INPP5F-201ENST00000361976 5063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEP1-209ENST00000556935 7643 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYO5A-202ENST00000358212 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYO5A-206ENST00000399233 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZAN-206ENST00000618565 8651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLGA8A-202ENST00000432566 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 C16orf62-203ENST00000438132 3855 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF765-206ENST00000594030 7588 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCPG1-201ENST00000310958 6822 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF263-201ENST00000219069 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA68B-201ENST00000364518 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LY6G6E-225ENST00000383418 383 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGLV3-32-201ENST00000390303 383 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP221-201ENST00000411271 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPS18BP1-201ENST00000414228 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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