Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC61Q9Y6R9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC61Q9Y6R9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms