Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms