Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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SNX13Q9Y5W8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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SNX13Q9Y5W8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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SNX13Q9Y5W8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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SNX13Q9Y5W8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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SNX13Q9Y5W8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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SNX13Q9Y5W8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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SNX13Q9Y5W8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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SNX13Q9Y5W8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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SNX13Q9Y5W8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX13Q9Y5W8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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