Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9Y3F1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9Y3F1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9Y3F1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9Y3F1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9Y3F1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9Y3F1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9Y3F1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9Y3F1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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