Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMC3Q9UQE7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMC3Q9UQE7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms