Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNH4Q9UQ05 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNH4Q9UQ05 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms