Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RARRES3Q9UL19 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms