Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL1Q9UK58 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms