Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms