Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SH3BP4Q9P0V3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4Q9P0V3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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