Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR7Q9NYK1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR7Q9NYK1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms