Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VNN3Q9NY84 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms