Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3AQ9NVI7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms