Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC4Q9NTJ3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms