Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms