Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms