Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FSCN3Q9NQT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FSCN3Q9NQT6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms