Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PFDN4Q9NQP4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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