Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms