Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK5

AGO4, Protein argonaute-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGO4Q9HCK5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AGO4Q9HCK5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGO4Q9HCK5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGO4Q9HCK5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGO4Q9HCK5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGO4Q9HCK5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGO4Q9HCK5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AGO4Q9HCK5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGO4Q9HCK5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGO4Q9HCK5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGO4Q9HCK5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AGO4Q9HCK5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms