Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms