Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms