Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms