Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNG6Q9BXT2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNG6Q9BXT2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms