Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms