Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FYCO1Q9BQS8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms