Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CMSS1Q9BQ75 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms