Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PCNX1Q96RV3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCNX1Q96RV3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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