Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms